Основные научные направления ИФПБ РАН связаны с исследованиями молекулярных механизмов фотобиологических процессов преобразования и запасания энергии света, работами в области фотобиотехнологии, молекулярной биологии, изучением физико-химических проблем функционирования, устойчивости и адаптации агро- и природных экосистем к внешним воздействиям.

В Институте работают около 200 человек, из которых половина - научные сотрудники. Среди научных сотрудников 71 кандидат и 20 докторов наук, один академик РАН. Научная продукция Института - около 70 публикаций в отечественных и международных журналах ежегодно. В Институте функционирует аспирантура по 8 специальностям и диссертационный совет по 3 специальностям ("биофизика", "биохимия", "физиология и биохимия растений").